宝宝在睡觉时不停摇头可能是环境不适、皮肤问题或耳部感染等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1. 环境不适宝宝可能因为睡眠环境过热或过冷而感到不适，导致摇头。改善环境温度，保持适宜的室温和湿度，有助于宝宝安稳入睡。
2. 皮肤问题宝宝的皮肤敏感，可能因为湿疹、痱子等皮肤问题而感到瘙痒，不自觉地摇头。可以使用炉甘石洗剂、氢化可的松软膏、糠酸莫米松软膏等药物缓解症状，但应在医生指导下使用。
3. 耳部感染宝宝摇头可能是中耳炎或外耳道炎等耳部感染引起的。可以使用头孢克洛干混悬剂、阿莫西林颗粒、罗红霉素干混悬剂等抗生素治疗，但需遵医嘱用药。
除以上原因外，还可能与神经系统疾病等因素有关。家长应密切观察宝宝的症状变化，及时就医，以免延误病情。