新型隐球菌感染最常见的部位是中枢神经系统，尤其是脑部。这种真菌感染通常首先影响肺部，但随着病情发展，它可能通过血液循环传播到大脑，导致脑膜炎或脑炎。
新型隐球菌感染的传播途径多样，包括吸入受污染的空气、土壤或鸟类粪便中的真菌孢子。感染后，真菌可能在肺部形成病灶，如果不及时治疗，它们可以进入血液循环，进而侵犯中枢神经系统。在中枢神经系统中，新型隐球菌能够引起炎症反应，导致头痛、发热、颈部僵硬等症状，严重时甚至可能危及生命。
对于新型隐球菌感染，日常建议包括保持良好的个人卫生，避免接触可能受污染的环境。一旦出现上述症状，应及时就医，并在医生指导下接受治疗，不可自行盲目用药，以免延误病情。