发烧后全身疼痛可能是由于肌肉炎症、病毒感染或免疫系统异常等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1. 肌肉炎症剧烈运动或长时间保持同一姿势可能导致肌肉疲劳和炎症，引起全身疼痛。治疗时可使用非甾体抗炎药如布洛芬、双氯芬酸钠和依托考昔等缓解炎症和疼痛，应在医生指导下使用。
2. 病毒感染流感病毒等感染可引起发烧和全身肌肉疼痛。治疗时可使用抗病毒药物如奥司他韦、阿昔洛韦和利巴韦林等，同时使用解热镇痛药如对乙酰氨基酚、布洛芬和阿司匹林等缓解症状，需遵医嘱用药。
3. 免疫系统异常系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病可引起发烧和全身疼痛。治疗时可使用糖皮质激素如泼尼松、甲泼尼龙和地塞米松等抑制免疫反应，同时使用非甾体抗炎药缓解疼痛，需在医生指导下长期规律用药。
除以上原因外，还可能与肿瘤、代谢性疾病等因素有关。发烧后全身疼痛时，应多休息、多饮水，必要时及时就医，明确病因后针对性治疗。