腘窝囊肿一般不会自愈。腘窝囊肿是位于膝关节后方的囊肿，多由关节滑囊炎、关节囊损伤或关节退行性病变引起。囊肿内充满关节液，随着囊肿增大，可能引起膝关节活动受限、疼痛等症状。
治疗腘窝囊肿通常需要药物治疗和物理治疗相结合。常用的药物有布洛芬、双氯芬酸钠和依托考昔等非甾体抗炎药，可以缓解疼痛和消炎。此外，硫酸软骨素和氨基葡萄糖等药物可以改善关节软骨状况，减缓关节退行性病变。在医生指导下用药，配合物理治疗如冷敷、按摩等，有助于缓解症状。
对于腘窝囊肿，建议尽早就医，明确诊断后在医生指导下进行综合治疗，以免延误病情。