通常，男性感染HPV后，部分情况下可以自愈。这是因为人体免疫系统具有一定的清除病毒的能力，尤其是对于低危型的HPV感染。然而，并非所有HPV感染都能自愈，特别是对于高危型HPV，它们与生殖器疣和某些癌症的发生有关。
对于男性HPV感染，常见的处理方式包括使用免疫增强剂如干扰素，以及局部应用药物如三氯醋酸和酊剂，这些药物可以在医生指导下使用，以减少疣体和控制病毒复制。此外，还有疫苗可以预防某些HPV类型的感染，但对已感染的个体治疗效果有限。
对于男性HPV感染者，重要的是定期进行医学检查，并遵循医生的建议进行治疗。保持健康的生活方式，如戒烟、适量运动和均衡饮食，也有助于增强免疫力，对抗HPV感染。