吃了荸荠后排出来很多黑虫子可能是荸荠携带寄生虫、消化系统感染或食物中毒等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1. 荸荠携带寄生虫荸荠生长在水田中，可能携带姜片虫等寄生虫。姜片虫感染后，幼虫会进入人体肠道，导致腹泻、腹痛等症状。治疗时可使用阿苯达唑片、甲硝唑片等药物，应在医生指导下用药。
2. 消化系统感染荸荠表面可能附着细菌、病毒等病原体，食用后引起肠道感染。可表现为腹痛、腹泻、发热等症状。治疗时可使用头孢克肟胶囊、复方黄连素片等抗生素或抗病毒药物，需遵医嘱用药。
3. 食物中毒荸荠变质后会产生毒素，食用后可能引起食物中毒。表现为恶心、呕吐、腹泻等症状。治疗时可使用蒙脱石散、口服补液盐等药物缓解症状，必要时需就医治疗。
除以上原因外，还可能与个人体质、过敏等因素有关。建议平时注意饮食卫生，生食荸荠前要充分清洗、去皮，如有不适症状应及时就医。