通常，腘窝囊肿的处理方式是手术切除。这是因为腘窝囊肿多由关节滑囊炎症或关节液外渗引起，手术可以清除囊肿，减少复发的可能。在手术前，医生会根据囊肿的大小、位置和病人的症状来评估手术的必要性和风险。较小的囊肿可能通过保守治疗如穿刺抽液和注射药物来缓解症状，但这种方法可能无法根治，且有复发的风险。
对于腘窝囊肿，日常建议包括避免过度使用受影响的关节，减少剧烈运动，以降低囊肿增大或破裂的风险。如果囊肿影响到日常活动或持续增大，应及时就医。在治疗过程中，患者应遵医嘱用药，不可自行盲目用药，以免造成不必要的副作用或影响治疗效果。