阴茎里面隐隐作痛可能是由于局部创伤、尿道感染或前列腺炎等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.局部创伤阴茎受到外力撞击或过度拉伸，可能导致内部组织损伤，引起疼痛。治疗时可采用冷敷减轻肿胀，并在医生指导下使用非甾体抗炎药如布洛芬、双氯芬酸钠和依托考昔等缓解疼痛。
2.尿道感染细菌侵入尿道，引发感染，导致尿道炎症，可能引起阴茎疼痛。治疗尿道感染可使用抗生素如阿莫西林、左氧氟沙星和头孢克肟等，在医生指导下按疗程用药。
3.前列腺炎前列腺受到细菌感染，引起炎症反应，可能导致阴茎疼痛。治疗前列腺炎可使用抗生素如阿奇霉素、多西环素和氟康唑等，同时使用α受体拮抗剂如特拉唑嗪和阿罗洛尔等缓解症状，均需遵医嘱用药。
除以上原因外，还可能与性传播疾病等因素有关。平时注意个人卫生，避免不洁性生活，出现症状及时就医检查治疗。