甲状腺囊肿一般不会自愈。甲状腺囊肿是甲状腺组织内形成的液体充满的囊性结构，大多数囊肿是良性的，但它们可能会增大或引起压迫症状。囊肿的自愈情况较为罕见，通常需要通过医学干预来处理。
囊肿的治疗取决于其大小、是否引起症状以及是否影响甲状腺功能。常见的治疗方法包括使用甲状腺激素抑制剂如左甲状腺素钠、利甲状腺素和丙硫氧嘧啶来抑制甲状腺激素的过度分泌，有时也会采用穿刺抽吸术来缓解囊肿引起的压迫感。在某些情况下，如果囊肿很大或者有恶性风险，可能需要手术切除。所有这些治疗方法都应在医生的指导下进行，以确保安全和有效。
对于甲状腺囊肿患者来说，定期的医学监测和评估是非常重要的。如果囊肿增大或出现新的症状，应及时就医，遵循医生的建议进行治疗。