通常来说，胃镜和喉镜的痛苦程度因人而异，但大多数人可能会觉得胃镜相对更难受一些。胃镜需要将一根软管从口腔插入，通过食管进入胃部，过程中可能会引起恶心、呕吐等不适感。喉镜则是通过口腔或鼻腔插入，检查喉部，虽然也会引起不适，但相对来说，不适感较轻，持续时间较短。
胃镜检查时，由于软管较长，需要经过整个食管，所以不适感较为明显。此外，胃镜检查时需要充气，使胃壁展开，以便观察，这个过程也会引起不适。相比之下，喉镜检查时，软管较短，只需经过口腔或鼻腔，不适感相对较轻。且喉镜检查时不需要充气，不适感持续时间也较短。
对于需要进行胃镜或喉镜检查的患者，建议在检查前做好心理准备，放松心情，配合医生的操作。检查后如果出现不适，应及时向医生反馈。同时，遵医嘱用药，不可自行盲目用药，以免加重不适。如有必要，可在医生指导下使用一些缓解不适的药物。