茅草根和鱼腥草在中草药中都有一定的药用价值，但它们通常具有以下区别。
1. 来源差异茅草根来源于禾本科植物茅草的根，而鱼腥草则来源于三白草科植物蕺菜的全草。
2. 功效区别茅草根具有清热利湿、凉血止血的功效，常用于治疗热病烦渴、吐血等症状；鱼腥草则以其清热解毒、消痈排脓的特性，适用于治疗肺痈吐脓、疮疡肿毒等病症。
3. 应用领域茅草根多用于内科和妇科的疾病治疗，而鱼腥草则更广泛地应用于外科和皮肤科。
在日常保健中，了解不同草药的特性对于合理使用至关重要。若出现相关症状，应及时就医，并在专业医师指导下使用草药进行治疗。