通常，新生儿室间隔缺损有一定的自愈几率。这种先天性心脏病的自愈率受到缺损的大小、位置以及患儿的整体健康状况的影响。小的室间隔缺损在婴儿期或儿童早期有较高的自愈可能性，而较大的缺损则可能需要通过手术来修复。室间隔缺损的自愈率在不同研究中有所差异，但一般认为在30%到50%之间。
室间隔缺损的大小是影响自愈几率的重要因素。小的缺损由于血流动力学的影响较小，心脏组织有可能自然生长覆盖缺损，从而实现自愈。而较大的缺损由于对心脏功能的影响较大，自愈的可能性相对较低。此外，缺损的位置也会影响自愈的可能性，某些位置的缺损更容易被心脏组织覆盖。患儿的年龄、营养状况和是否有并发症也是影响自愈几率的因素。
对于室间隔缺损的患儿，家长应定期带孩子进行心脏检查，监测缺损的变化，并遵循医生的建议。如果缺损较大或有并发症，可能需要在医生指导下进行药物治疗或手术治疗。家长应避免自行给孩子用药，所有治疗都应在专业医生的指导下进行。