放线菌通常被归类为细菌。它们是一类具有分枝状菌丝结构的革兰阳性菌，与真菌在形态上有一定的相似性，但在细胞结构和生物分类上属于细菌界。
放线菌在自然界中广泛分布，它们在土壤、水体和植物中都有存在。放线菌中有些种类能够产生抗生素，如链霉素、红霉素和四环素等，这些抗生素在医学上具有重要的应用价值。由于放线菌的某些特性与真菌相似，因此在分类上有时会存在混淆，但它们在细胞壁成分、代谢途径等方面与真菌有明显区别，应在医生指导下使用这些抗生素。
在选择抗生素时，应考虑个体的健康状况、病原体类型以及药物的适应症和副作用，以确保安全有效。