扁平疣发痒可能是由于皮肤受到刺激、局部炎症反应或是病毒感染加剧等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1. 皮肤刺激扁平疣表面可能因为摩擦、汗液刺激或衣物摩擦导致局部皮肤发痒，此时应保持皮肤干燥清洁，避免过度摩擦。
2. 局部炎症扁平疣周围的皮肤可能因为局部炎症反应而出现瘙痒，此时可以使用抗组胺药物如氯雷他定、盐酸西替利嗪和苯海拉明等缓解症状，但需在医生指导下使用。
3. 病毒感染加剧扁平疣是由人乳头瘤病毒感染引起的，当病毒复制活跃时，疣体可能增大，引起瘙痒。此时可以使用外用药物如水杨酸、三氯醋酸和氟尿嘧啶等进行治疗，但需遵医嘱用药。
除以上原因外，还可能与个人体质、过敏等因素有关，建议日常保持皮肤清洁，避免刺激性物质接触，并及时就医治疗。