巧克力囊肿手术后怀孕几率通常受多种因素影响。手术可以移除囊肿，减少对卵巢功能的损害，从而提高怀孕的可能性。然而，怀孕几率也与囊肿的大小、位置、手术方式及个体差异有关。
囊肿的大小和位置可能影响卵巢功能，较大的囊肿或位置不佳的囊肿可能对卵巢造成较大损害，影响排卵和怀孕。手术方式也很重要，微创手术可能减少对卵巢的损伤，提高怀孕几率。此外，个体差异如年龄、卵巢储备功能等也会影响怀孕几率。
对于巧克力囊肿患者，建议手术后定期复查，监测卵巢功能。如有怀孕计划，可在医生指导下尝试。若长时间未能怀孕，应及时就医，评估卵巢功能和生育能力，必要时可考虑辅助生殖技术。遵医嘱用药，不可自行盲目用药。