通常，怀孕时出现的囊肿是否会影响胎儿，取决于囊肿的类型、位置和大小。一般情况下，大多数囊肿不会对怀孕和胎儿造成影响，但如果囊肿较大或者位置特殊，可能会对怀孕过程和胎儿产生一定的影响。
囊肿可以是良性的，如卵巢囊肿，也可以是恶性的，如卵巢癌。常见的囊肿包括卵巢囊肿、子宫肌瘤和子宫腺肌症。例如，卵巢囊肿可能因为体积增大而压迫周围组织，导致疼痛或不适；子宫肌瘤如果位于子宫腔内，可能会影响胚胎的着床；子宫腺肌症可能会引起痛经和月经不规律，影响怀孕。这些情况下，应在医生指导下使用药物治疗，以控制症状和保护胎儿健康。
对于怀孕时发现的囊肿，重要的是及时咨询医生，进行必要的检查和评估，以确定囊肿的性质和是否需要治疗。医生会根据具体情况制定治疗方案，确保母婴安全。