牙齿根部发黑可能是食物残渣沉积、牙菌斑形成或牙釉质损伤等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1. 食物残渣沉积日常饮食中，食物残渣容易附着在牙齿表面，尤其是牙齿根部，长期积累可能导致牙齿发黑。这种情况下，可以通过刷牙和使用牙线来清除食物残渣，保持口腔卫生。
2. 牙菌斑形成牙菌斑是由细菌、唾液和食物残渣混合形成的软质沉积物，如果不及时清除，会导致牙齿表面变色。治疗牙菌斑，可以使用含氟牙膏刷牙，同时定期到医院进行洁牙，以去除牙菌斑。
3. 牙釉质损伤牙釉质是牙齿表面的保护层，如果受损，牙齿容易发黑。牙釉质损伤可能由于长期饮用含氟量过高的水或酸性饮料引起。治疗牙釉质损伤，可以使用氟化物漱口水和含氟牙膏，同时避免饮用酸性饮料。
除以上原因外，还可能与口腔卫生习惯不良等因素有关。建议定期到医院进行口腔检查，发现问题及时治疗，同时保持良好的口腔卫生习惯。