黄连上清丸吃了拉肚子可能是由于药物副作用、个体体质差异或消化系统疾病等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1. 药物副作用黄连上清丸中含有黄连等成分，部分人服用后可能会出现腹泻等胃肠道反应。此时可咨询医生调整用药方案，必要时更换其他药物，如板蓝根颗粒、银翘解毒片等，以减轻不适。
2. 个体体质差异不同人对药物的反应不同，部分人对黄连上清丸中的某些成分较为敏感，可能会出现腹泻等不良反应。此时可在医生指导下减少用药剂量或更换其他药物，如牛黄解毒片、复方黄连素片等。
3. 消化系统疾病黄连上清丸主要用于治疗上火引起的咽喉肿痛、口舌生疮等症状。如果本身存在消化系统疾病，如慢性胃炎、肠炎等，服用黄连上清丸可能会加重腹泻等症状。此时应及时就医，针对消化系统疾病进行规范治疗，如使用奥美拉唑、枸橼酸铋钾等药物。
除以上原因外，还可能与饮食不当、情绪紧张等因素有关。建议在用药期间注意饮食清淡，避免辛辣刺激性食物，保持良好的心态。如腹泻症状持续不缓解，应及时就医，以免延误病情。