同房时小腹疼痛可能是由于性生活过程中的体位不当、生殖系统疾病或心理因素等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1. 体位不当性生活时如果体位不当，可能会对腹部造成压迫，导致小腹疼痛。在性生活中应选择舒适且不压迫腹部的体位，必要时可垫高臀部以减轻腹部压力。
2. 生殖系统疾病如子宫内膜异位症、盆腔炎等生殖系统疾病也可能导致同房时小腹疼痛。对于这类疾病，一般需要使用抗生素、激素类药物等进行综合治疗，如头孢类抗生素、甲硝唑、黄体酮等，应在医生指导下用药。
3. 心理因素性生活时紧张、焦虑等不良情绪也可能引起小腹疼痛。应放松心情，必要时可咨询心理医生，必要时可使用抗焦虑药物如地西泮、帕罗西汀等，遵医嘱用药。
除以上原因外，还可能与性生活过于频繁、粗暴等因素有关。日常生活中应避免过于频繁的性生活，动作要轻柔，必要时可使用润滑剂减少摩擦。如疼痛持续不缓解，应及时就医检查，明确病因，对症治疗。