HPV感染通常不会自愈，但部分HPV类型引起的感染在免疫力正常的情况下，可能随着时间的推移而自行消退。
HPV感染后，人体免疫系统会尝试清除病毒。对于低危型HPV，如HPV6和HPV11，通常不会导致严重的健康问题，大多数感染者可以在1-2年内自然清除病毒。然而，对于高危型HPV，如HPV16和HPV18，它们与宫颈癌等严重疾病相关，自然清除的可能性较低，可能需要医疗干预。在治疗过程中，可能使用的药物包括干扰素、免疫增强剂和抗病毒药物等，应在医生指导下使用。
面对HPV感染，重要的是定期进行筛查，并在医生指导下采取适当的治疗措施。