阴茎上长小疙瘩可能是毛囊炎、皮脂腺囊肿或尖锐湿疣等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.毛囊炎
由于局部皮肤毛囊受到细菌感染，可能出现红肿疼痛的小疙瘩。治疗时可使用红霉素软膏、氯霉素软膏等外用抗生素药膏，必要时口服头孢类抗生素，如头孢克洛、头孢拉定等，需遵医嘱用药。
2.皮脂腺囊肿
皮肤表面皮脂腺阻塞，形成囊肿样小疙瘩。一般无需特殊治疗，保持局部清洁干燥即可。如囊肿较大，可手术切除，术后使用碘伏、红霉素软膏等预防感染。
3.尖锐湿疣
由人乳头瘤病毒感染引起的性传播疾病，表现为菜花状、乳头状的疣状物。治疗可使用外用药物如鬼臼毒素酊、咪喹莫特乳膏等，必要时进行冷冻、激光等物理治疗，同时口服阿昔洛韦、更昔洛韦等抗病毒药物，需在医生指导下用药。
除以上原因外，还可能与过敏、湿疹等因素有关。平时注意个人卫生，避免不洁性行为。如小疙瘩持续增多、增大，应及时就医，明确诊断，对症治疗。