一般深呼吸时咳嗽可能是由于空气刺激、过敏反应或肺部疾病等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1. 空气刺激空气中的灰尘、烟雾等颗粒物可能刺激呼吸道，导致咳嗽。在空气质量不佳时，应减少户外活动，保持室内空气清新。
2. 过敏反应对某些物质过敏，如花粉、宠物毛发等，可能引起咳嗽。应避免接触过敏原，并可在医生指导下使用抗过敏药物如非诺贝特、氯雷他定和盐酸西替利嗪等。
3. 肺部疾病如慢性支气管炎、哮喘等疾病，可能在深呼吸时引发咳嗽。应到医院检查确诊，并根据医生建议使用药物如布地奈德、沙美特罗和氨茶碱等控制症状。
除以上原因外，还可能与呼吸道感染等因素有关。日常生活中应注意增强免疫力，保持室内空气流通，如症状持续不缓解，应及时就医检查。