甲硝唑和替硝唑作为抗厌氧菌和原虫感染的常用药物，通常有以下区别：作用机制不同、适应证不同、副作用不同。
1.作用机制不同甲硝唑通过干扰细菌的DNA合成，抑制细菌生长；而替硝唑除了具有甲硝唑的作用外，还对某些厌氧菌和原虫具有较强的杀灭作用。
2.适应证不同甲硝唑主要用于治疗厌氧菌引起的感染，如牙周炎、盆腔炎等；替硝唑则适用于治疗厌氧菌和原虫感染，如阿米巴痢疾、滴虫性阴道炎等。
3.副作用不同甲硝唑和替硝唑都可能出现恶心、呕吐等胃肠道反应，但替硝唑的副作用相对较轻，发生率较低。
对于厌氧菌和原虫感染的患者，日常生活中应注意个人卫生，避免接触不洁水源。如出现相关症状，应及时就医，遵医嘱合理用药，以免延误病情。