巴氏腺囊肿通常不会自愈，需要通过医学手段进行治疗。巴氏腺囊肿是由于巴氏腺管阻塞引起的，囊肿内充满脓液或分泌物，导致局部肿胀和疼痛。轻微的囊肿可能通过热敷和抗生素治疗得到缓解，但大多数情况下，囊肿需要通过手术引流或切除来彻底解决问题。手术可以是门诊小手术，也可以在全麻下进行，具体取决于囊肿的大小和位置。
巴氏腺囊肿如果不及时治疗，可能会导致感染扩散，形成脓肿，甚至影响周围组织。因此，一旦发现巴氏腺囊肿，应及时就医，根据医生的建议选择合适的治疗方案。在治疗过程中，患者应遵医嘱用药，不可自行盲目用药，以免延误病情或产生不良反应。