卵巢囊肿一般不会直接影响怀孕，但具体情况需要根据囊肿的大小、性质和位置来判断。较小的囊肿可能不会对怀孕造成影响，但如果囊肿较大或者位置不佳，可能会对卵巢功能产生影响，从而影响排卵和怀孕。
卵巢囊肿可能包括功能性囊肿、皮样囊肿和子宫内膜异位囊肿等。例如，黄体囊肿、滤泡囊肿和巧克力囊肿等，这些囊肿在医生指导下使用药物如黄体酮、促排卵药物和抗炎药物等治疗时，通常不会影响怀孕。但是，如果囊肿过大或存在并发症，可能需要手术干预，这时应遵医嘱进行相应治疗。
对于卵巢囊肿患者，建议定期进行妇科检查，及时了解囊肿的变化，并在医生指导下采取合适的治疗措施。