长期服用三七粉可能引起出血风险增加、消化系统不适、过敏反应、药物相互作用以及肝肾功能负担等危害。三七粉作为中药需在医生指导下合理使用，避免自行长期服用。
三七粉具有活血化瘀的功效，但长期过量服用可能抑制血小板聚集，导致凝血功能异常，增加皮下出血、鼻衄、牙龈出血等风险。对于本身存在出血性疾病或正在使用抗凝药物的人群，这种风险更为显著。部分人群服药后可能出现胃部灼热感、恶心、呕吐等消化道刺激症状，这与三七皂苷成分对胃肠黏膜的直接作用有关。临床曾报道服用三七粉引发过敏性紫癜、药疹等免疫反应案例，提示个体差异可能诱发过敏。
三七粉与华法林钠、阿司匹林等抗凝药物联用时，可能产生协同作用，使国际标准化比值异常升高。对于慢性肝肾疾病患者，长期服药可能影响药物代谢酶活性，虽然三七本身不具有明确肝肾毒性，但会加重已有器官功能损伤患者的代谢负担。建议用药期间定期监测凝血功能、肝肾功能等指标。
服用三七粉出现黑便、皮肤瘀斑等出血倾向时应立即停药。特殊人群如围手术期患者、孕妇等应严格遵医嘱用药。中药治疗需辨证施治，不建议将三七粉作为保健品长期使用，以免掩盖真实病情，延误疾病诊治。