雾化吸入通常建议通过嘴部吸入药物，鼻腔结构可能过滤部分药物成分，影响疗效。但对于婴幼儿或无法配合嘴吸的患者，使用面罩时可能需经鼻吸入。
雾化吸入时用嘴呼吸能保证药物直达下呼吸道，减少鼻腔黏膜对药物的吸附。尤其是治疗支气管或肺部疾病时，药物颗粒更容易通过口腔直接进入气道，提高局部药物浓度。成人及能配合的儿童应保持嘴唇包紧咬嘴，缓慢深呼吸。
面罩雾化时药物会经鼻腔和口腔同时进入，适用于无法自主呼吸配合的婴幼儿或意识不清患者。但部分直径较大的药物颗粒可能被鼻毛阻隔，此时需适当延长雾化时间。使用面罩时应保持垂直佩戴，避免药雾喷入眼睛。
雾化完成后建议清水漱口，婴幼儿可喂少量温水。不同雾化装置和药物可能有特殊使用要求，具体吸入方式应遵医嘱。治疗期间若出现异常呛咳或不适，应及时停止并联系医护人员调整治疗方案。