清胃黄连丸是否能治疗口臭需要根据具体病因进行判断。该药物主要适用于胃火炽盛引起的口臭，若由其他原因导致，则可能无法达到理想效果。
清胃黄连丸含有黄连、黄芩等成分，具有清胃泻火的功效。对于胃火旺盛引起的口臭，这类患者常伴有牙龈肿痛、口渴喜冷饮、便秘尿黄等症状，药物通过清除胃部实热，可改善由胃火上炎导致的口腔异味。但对于龋齿、牙周炎等口腔疾病引发的口臭，该药物作用有限，此类情况需通过洁牙、填充治疗等口腔科处理。
长期进食大蒜等重口味食物造成的暂时性口臭，通常不需要药物治疗，保持口腔清洁即可自行缓解。若是慢性鼻窦炎、扁桃体结石等耳鼻喉科疾病引起的口臭，则需要针对原发病进行治疗。糖尿病酮症酸中毒等代谢性疾病导致的口臭，更需及时控制血糖等基础指标。
出现持续性口臭建议先就诊口腔科排查常见病因，若伴有明显胃部不适可至消化科检查。使用清胃黄连丸前应经中医师辨证，确认属于胃火亢盛证型后再行服用。日常应注意饭后漱口、定期洁牙，避免过度食用辛辣刺激食物。