进行肠镜检查通常需要就诊消化内科或内镜中心。部分医院可能将内镜检查归入胃肠外科，但大多数情况下消化内科是首诊科室。
消化内科主要负责消化道疾病的诊断与治疗，肠镜检查是其常用的检查手段之一。医生通过内镜观察结肠黏膜状态，可筛查息肉、溃疡、肿瘤等病变。若发现可疑病灶，还能直接取样活检。内镜中心是专门开展胃肠镜检查的部门，配备专业设备和操作人员，但通常需要由消化内科医生开具检查单后进行预约。
少数情况下，如患者因肠梗阻、肠穿孔等急症入院，可能由普外科安排紧急肠镜检查。但常规筛查或慢性肠道问题，仍建议首选消化内科就诊。检查前需提前3天低渣饮食，并按医嘱服用肠道清洁剂。检查当天需携带病历资料和既往检查报告，方便医生综合评估。
建议就诊前通过医院官网或导诊台确认具体科室设置。检查后如有病理取样，需按通知时间复诊取报告，消化科医生会根据结果制定后续治疗方案。特殊人群如孕妇、严重心肺疾病患者，需提前告知医生评估检查风险。