怀孕6周通常可以进行药物流产，但需满足妊娠时间在49天内且经B超确认为宫内妊娠，同时排除药物禁忌症。药物流产适用于无严重全身性疾病、无肾上腺或青光眼等禁忌症的健康女性，需在医生指导下规范使用药物。
药物流产需严格遵循妊娠时间限制，通常适用于停经49天内的早期妊娠。怀孕6周处于此时间范围内，但必须通过B超检查确认孕囊位置在宫腔内，排除宫外孕可能性。若存在药物过敏史、哮喘或心血管疾病等禁忌症，则不宜选择药物流产。
药物流产需在医生指导下进行，常用米非司酮与米索前列醇联合用药。用药后需观察孕囊排出情况，并按时复查超声确认流产效果。若出现大出血、剧烈腹痛或持续发热等症状，需立即就医处理。
药物流产后需注意休息，避免过度劳累，保持外阴清洁卫生。两周内禁止盆浴及性生活，按医嘱复查以排除残留或感染风险。若有生育需求，建议间隔3-6个月后再备孕，期间采取有效避孕措施。