生殖器上长水泡可能与生殖器疱疹、过敏反应、毛囊炎等疾病有关，需根据具体病因进行治疗。日常应避免抓挠患处，并及时就医明确诊断。
1、生殖器疱疹由单纯疱疹病毒感染引起，属于性传播疾病。典型症状为簇集性水疱，伴随疼痛或瘙痒。治疗需遵医嘱使用抗病毒药物，如阿昔洛韦片、泛昔洛韦胶囊、喷昔洛韦乳膏等，可抑制病毒复制并促进愈合。
2、过敏反应接触过敏原如避孕套材质、洗液成分等可能导致局部水疱，常伴红肿、瘙痒。需立即停用可疑致敏物质，并在医生指导下口服氯雷他定片、西替利嗪片或外用炉甘石洗剂，缓解过敏症状。
3、毛囊炎局部毛囊细菌感染可能形成红色丘疹或脓疱，多由金黄色葡萄球菌感染引发。可外用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏或口服头孢克肟胶囊等抗生素治疗，同时保持皮肤清洁干燥。
若水泡反复出现或伴有发热、溃疡等症状，建议及时到皮肤科或感染科就诊，进行HSV抗体检测、分泌物培养等检查。治疗期间应避免性生活，穿着宽松棉质内衣，避免辛辣刺激饮食，以促进皮肤修复。