肛瘘是否会引起疼痛通常需要根据病情严重程度以及是否合并感染等因素来判断。肛瘘是肛管直肠与皮肤之间的异常通道，多数情况下可能伴随局部疼痛或不适感，但具体症状因人而异。
当肛瘘处于急性感染期或形成脓肿时，局部可能出现红肿、灼热感，并伴随明显的疼痛。此时活动或排便可能加重疼痛，部分患者还可能存在肛门周围皮肤破溃、流脓等症状。若肛瘘长期未得到有效治疗，瘘管反复感染可能导致慢性疼痛，但疼痛程度可能较急性期有所减轻。
如果肛瘘位置较深或存在多个瘘管分支，疼痛可能更为明显，甚至影响日常坐卧或行走。部分患者的肛瘘可能因瘘管堵塞、脓液积聚而引发剧烈疼痛，此时需及时就医处理。此外，肛瘘合并其他肛周疾病如痔疮、肛裂时，也可能导致疼痛程度加重。
建议肛瘘患者尽早就诊，通过肛门指检、超声等检查明确病情，并在医生指导下选择药物治疗、切开引流或手术切除等方案。避免因拖延治疗导致病情加重或引发肛周广泛感染。