肝囊肿患者通常没有特效药物能直接消除囊肿，但对于继发感染、疼痛或体积较大的情况，一般可遵医嘱使用抗生素、止痛药、促吸收类药物等进行对症治疗。
1、抗生素若肝囊肿合并细菌感染，出现发热、局部压痛等症状时，可在医生指导下使用头孢克肟分散片、阿莫西林胶囊、左氧氟沙星片等抗生素控制感染。这类药物通过抑制细菌细胞壁合成或干扰DNA复制发挥抗菌作用，但无法直接消除囊肿结构。
2、止痛药当囊肿增大压迫肝包膜引起右上腹胀痛时，可短期使用布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片、双氯芬酸钠缓释片等非甾体抗炎药缓解疼痛。此类药物通过抑制前列腺素合成减轻痛感，但长期使用可能损伤胃黏膜，需严格遵循剂量要求。
3、促吸收类药物部分临床研究显示桂枝茯苓丸、大黄蛰虫丸等中成药可能有助于减缓囊肿增长速度。其作用机制可能与改善局部微循环有关，但缺乏大规模循证医学证据支持，建议在中医师辨证指导下使用。
肝囊肿属于结构性病变，药物仅能缓解继发症状，无法使现有囊肿消失。若囊肿直径超过5cm或引发持续性疼痛、黄疸等压迫症状，需考虑超声引导下穿刺抽液或腹腔镜囊肿开窗术等介入治疗。日常应注意避免腹部撞击，定期复查超声监测囊肿变化，出现发热、剧烈腹痛时应及时就诊肝胆外科。