HPV阳性的治疗方法需根据是否引起病变以及病变程度进行选择，通常包括随访观察、药物治疗、物理治疗、手术治疗以及免疫治疗等。
1、随访观察多数HPV感染可通过自身免疫力清除，尤其是一过性感染且无宫颈病变者。建议定期进行HPV检测和宫颈细胞学筛查，观察病毒载量和病变进展，通常每6-12个月复查一次。
2、药物治疗对于持续感染或合并低级别宫颈病变者，可遵医嘱使用干扰素栓、保妇康栓等药物抑制病毒复制，或使用红卡菌衍生物等调节局部免疫。外用药物如咪喹莫特乳膏可用于生殖器疣的辅助治疗。
3、物理治疗针对可见的生殖器疣或宫颈低级别病变，可采用激光、冷冻、电灼或光动力疗法直接清除病灶。这些方法能快速去除疣体，但需配合药物治疗降低复发风险。
4、手术治疗宫颈高级别鳞状上皮内病变（HSIL）患者需行宫颈锥切术，包括冷刀锥切或LEEP术。术后仍需定期随访，监测HPV感染状态和宫颈修复情况。
5、免疫治疗持续高危型HPV感染可考虑使用免疫调节剂，如口服胸腺肽、匹多莫德等增强机体细胞免疫功能。新兴的HPV治疗性疫苗尚处于临床试验阶段。
发现HPV阳性后应避免过度焦虑，但需重视定期妇科检查。治疗期间需保持外阴清洁，适当锻炼增强体质，避免不洁性行为。所有治疗方案均应在专业医生指导下进行，根据病理结果制定个体化诊疗方案。