支原体感染的症状因感染部位不同而有所差异，通常包括呼吸道症状、泌尿生殖系统症状以及全身性症状等。常见表现有咳嗽、发热、尿痛等，部分患者可能出现并发症。
呼吸道支原体感染以肺炎支原体最常见，可引发持续性干咳，夜间加重并伴有白色黏痰。发热多为中低度，部分儿童可能出现高热。患者常伴有咽部充血、胸骨后疼痛，听诊时肺部湿啰音不明显，这种体征与症状分离是其特征之一。泌尿生殖系统感染由生殖支原体引起时，男性多表现为尿道刺痛、排尿灼热感，尿道口可见稀薄分泌物；女性可能出现宫颈炎、盆腔炎，表现为下腹坠胀、异常阴道出血。
部分患者感染后2-4周可能出现肺外并发症，如多形性皮疹、游走性关节痛，严重者可发生溶血性贫血或脑膜炎。婴幼儿感染易出现喘息、气促等支气管痉挛表现，且病程较长可达3-4周。免疫功能低下者可能出现反复感染或症状迁延不愈。
若出现持续咳嗽超过1周伴低热、排尿异常或生殖道分泌物增多等情况，建议及时进行血清抗体检测或核酸检查。治疗期间需保持充足水分摄入，避免交叉感染。用药应严格遵循医嘱，完成规定疗程以防止耐药性产生。