藿香正气水含有酒精。该药物制作过程中通常会将药材用乙醇浸制或溶解，以达到提取有效成分的目的，因此成品中会残留一定量的酒精成分。
藿香正气水含酒精与其生产工艺密切相关。该药多采用酊剂制法，将中药材浸泡于高浓度乙醇溶液中，利用乙醇的溶解特性萃取药材中的挥发性成分，这种方式能更好地保留广藿香、紫苏等药材的有效物质，但会导致最终药液酒精浓度达到40%-50%。此外，酒精本身具有促进血液循环、辅助药效发挥的作用，同时还能抑制微生物滋生，延长药物保存期限。
对酒精过敏者、儿童、孕妇及肝功能不全者需慎用此药。服用后应避免驾驶或操作精密仪器，且服药期间不得与头孢类抗生素、甲硝唑等可能引起双硫仑样反应的药物同服。若需使用但存在酒精禁忌，可遵医嘱改用藿香正气胶囊、藿香正气口服液等无酒精剂型。具体用药方案建议咨询医师或药师。