儿童阴茎短小可能是生理性原因如隐匿阴茎或肥胖所致，也可能与病理性原因如小阴茎症有关，需及时就医明确诊断。
1、隐匿阴茎隐匿阴茎是由于阴茎皮肤与阴茎体固定不良，导致阴茎体埋藏在皮下脂肪中，外观看起来短小。这种情况属于生理性发育异常，可能伴随排尿异常、局部清洁困难等症状。通常可通过手术矫正，如阴茎成形术等。
2、肥胖肥胖可能导致儿童下腹部脂肪堆积，使阴茎被埋藏在脂肪层内，表现为阴茎短小。这类儿童常伴有体重超标、皮肤褶皱处易发炎等问题。治疗方法以控制体重为主，如调整饮食结构、增加运动量等，必要时需在医生指导下进行干预。
3、小阴茎症小阴茎症通常与先天性激素分泌异常有关，如促性腺激素缺乏、雄激素合成障碍等，导致阴茎长度低于同龄人平均水平。可能合并睾丸发育不良、第二性征延迟等症状。治疗需针对病因，如遵医嘱使用注射用重组人生长激素、十一酸睾酮胶丸、绒促性素注射液等药物补充激素。
若发现儿童阴茎外观异常，建议尽早就诊小儿内分泌科或泌尿外科，通过激素检测、影像学检查等明确病因。确诊后需严格遵循医嘱进行治疗，避免盲目使用药物或偏方，以免影响儿童正常发育。