阴茎根部疼痛可能是生理性原因所致，也可能与尿道炎、前列腺炎、精索静脉曲张等疾病因素有关，建议及时就医明确原因。若排除生理性因素，可能与以下疾病相关：
1、生理性原因阴茎根部皮肤或软组织受到压迫、摩擦等刺激时，可能引起短暂性疼痛。例如长时间骑自行车或久坐，局部持续受压导致血液循环不畅，可出现酸胀或隐痛感。这种情况通常在调整姿势、适当活动后缓解，一般无需特殊治疗。
2、尿道炎细菌、支原体等病原体感染尿道时，炎症可能蔓延至阴茎根部。患者常伴有尿频、尿急、尿道口灼热感等症状，急性期可能出现尿道分泌物。确诊后需遵医嘱使用头孢克肟片、左氧氟沙星片、阿莫西林胶囊等抗生素进行抗感染治疗，同时需增加饮水量。
3、前列腺炎前列腺发生细菌感染或长期充血时，可能引发放射性疼痛至阴茎根部。患者可能伴随会阴部胀痛、排尿不畅等症状。治疗通常需要联合使用左氧氟沙星片、坦索罗辛缓释胶囊、塞来昔布胶囊等药物控制炎症及缓解疼痛，同时需避免久坐和酒精刺激。
4、精索静脉曲张精索静脉回流受阻导致局部静脉丛异常扩张时，可能引发阴囊及阴茎根部坠胀痛，长时间站立后症状加重。轻度患者可遵医嘱服用地奥司明片改善循环，配合布洛芬缓释胶囊缓解疼痛，重度患者可能需要腹腔镜精索静脉高位结扎术。
若疼痛持续超过24小时或伴随红肿、排尿异常、发热等症状，应及时到泌尿外科就诊。需通过尿常规、前列腺液检查、超声等检测明确病因，避免自行服用止痛药物掩盖病情。日常需保持会阴部清洁干燥，选择透气性好的棉质内裤，避免剧烈运动造成局部反复摩擦。