男性感染人乳头瘤病毒是否需要治疗，通常需要根据是否出现临床症状进行判断。若无明显症状可能无需特殊治疗，但若出现病变则需及时干预。
如果男性感染人乳头瘤病毒后未引发任何临床症状，如生殖器部位未出现疣体或皮肤黏膜改变，通常属于潜伏感染或病毒携带状态。此时人体免疫系统可能在一至两年内自行清除病毒，一般无需药物治疗，但需定期复查人乳头瘤病毒载量变化。日常需保持良好作息习惯，避免熬夜或过度疲劳，以增强免疫力促进病毒清除。
当人乳头瘤病毒感染导致生殖器疣时，需积极进行治疗。局部可遵医嘱使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等药物进行腐蚀治疗，抑制疣体生长。对于体积较大的尖锐湿疣，建议采用液氮冷冻治疗、激光消融或手术切除等物理治疗方法。治疗后需保持创面清洁干燥，避免继发细菌感染，同时三个月内需复查是否复发。
合并其他病原体感染时需综合治疗。若存在支原体、衣原体等合并感染，可联合使用阿奇霉素片、盐酸多西环素片等抗生素。免疫功能低下患者可配合胸腺肽肠溶片、转移因子口服溶液等免疫调节剂辅助治疗。治疗期间应避免性接触，性伴侣需同步进行人乳头瘤病毒筛查。
建议每三个月至半年复查人乳头瘤病毒-DNA分型检测，持续监测病毒载量变化。日常生活中需注意个人卫生，避免使用公共浴池、坐便器等可能接触病毒的环境。若出现新的皮损或原有症状加重，应及时到皮肤性病科就诊，通过醋酸白试验、病理活检等明确病变性质。