安全期避孕并非绝对安全，一般只能作为参考方法，实际避孕效果因人而异。其可靠性受多种因素影响，如月经周期不规律、排卵时间波动等，存在意外妊娠的可能。
安全期避孕主要依靠推算排卵时间来规避易孕期。女性排卵时间可能因情绪波动、药物作用或疾病影响提前或延后，导致推算结果出现偏差。部分女性存在额外排卵现象，即便在安全期也可能有卵子排出。月经周期不规律的女性更难准确预测排卵日，此时安全期计算的误差率可高达20%-30%。
目前临床数据显示，安全期避孕的年失败率约为9%-25%，明显高于避孕套、短效避孕药等方法。对于月经周期在26-32天且高度规律的女性，正确使用安全期法避孕的有效率可达85%左右，但实际应用中多数人难以满足这些严格条件。
建议将安全期避孕作为辅助手段，与避孕套等物理屏障法联合使用。若出现月经周期紊乱或避孕失败情况，应及时采取紧急避孕措施。有长期避孕需求者，建议咨询医生选择更可靠的避孕方案。