石斛不适合体质虚寒、脾胃虚弱、感冒初期以及过敏体质的人群食用，以免引发不适。具体禁忌需结合个人体质和健康状况，必要时可咨询医生。
石斛作为一味滋阴类中药材，其药性微寒，可能加重虚寒体质人群的畏寒肢冷、小便清长等症状。脾胃虚弱者服用后易出现腹部冷痛、大便溏泄等消化系统不良反应，这与石斛寒凉特性影响脾胃运化功能有关。外感风寒引起的鼻塞流涕、发热恶寒等症状期间服用，可能因滋阴敛邪作用延缓病程恢复。
过敏体质人群接触石斛可能诱发皮肤瘙痒、红斑等过敏反应，严重时可能出现喉头水肿等全身症状。临床数据显示约0.3%-1.2%的中药过敏病例与石斛相关，特别是未规范炮制的药材更易引发致敏反应。
使用石斛前建议进行中医体质辨识，阴虚火旺体质者适宜在医师指导下服用。储存时需注意干燥防潮，若出现受潮霉变应立即停止使用。孕妇、哺乳期妇女等特殊人群如需使用，应严格遵循专业中医师的用药指导。