纤维支气管镜检查通常会有一定的不适感，但多数患者可以耐受。具体不适程度与个人敏感度、操作医生技术及检查目的有关，可能出现咽喉刺激、咳嗽反射或轻微疼痛。
检查过程中，纤维支气管镜需经口或鼻进入气道，可能引发咽喉部异物感和刺激性咳嗽，这是正常的生理反射。部分患者因紧张或敏感可能出现恶心、呼吸急促，但医生会提前进行表面麻醉并使用镇静药物缓解不适。操作时保持平稳呼吸、避免吞咽动作能有效减轻不适感。对于需要活检或治疗的患者，可能会有短暂疼痛，但通常使用局部麻醉即可控制。
建议检查前4-6小时禁食，穿着宽松衣物，提前向医生说明呼吸系统病史及药物过敏史。检查后2小时内暂缓进食饮水，出现持续胸痛、咯血或呼吸困难应及时告知医护人员。现代支气管镜直径仅5-6毫米且可弯曲，配合雾化麻醉和心电监护，多数患者反馈不适感在可接受范围内，不必过度焦虑。