显微取精手术过程中通常不会感到明显痛苦，但术后可能出现轻微不适感。具体感受因人而异，与麻醉效果、个体耐受度等因素有关。
手术一般采用局部麻醉或静脉麻醉，术中患者处于无痛状态。医生会在睾丸部位切开微小切口，借助显微镜寻找可能存在的精子。麻醉药物可有效阻断痛觉神经传导，因此操作时不会产生剧烈疼痛。
术后麻醉消退后，部分人可能感到睾丸区域胀痛、牵拉感，这种不适多在1-3天内自行缓解。医生通常会开具布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等镇痛药物帮助缓解症状。极少数情况下可能出现血肿、感染等并发症，可能加重疼痛感，需及时处理。
显微取精术后建议穿着宽松棉质内裤，避免剧烈运动。保持切口清洁干燥，按医嘱使用头孢克肟胶囊、阿莫西林胶囊等抗生素预防感染。若出现持续加重的疼痛、发热或异常肿胀，应及时到生殖医学科或泌尿外科复查。该手术作为男性不育的重要治疗手段，建议在专业医生指导下根据具体情况选择。