正确使用微波炉加热食物一般是安全的，不会对人体健康产生明显危害。但需注意加热方法和容器的选择，避免因操作不当或使用不合格容器引发问题。
微波炉通过微波使食物内的水分子振动产生热量，加热过程中不会改变食物的分子结构或产生有害物质。只要加热温度和时间适当，食物中的营养成分流失与其他加热方式相似。但需避免将食物加热至焦糊状态，以免生成可能有害的物质。部分水溶性维生素如维生素C和B族可能在长时间加热后有所减少，但这并非微波炉特有的问题。
使用微波炉加热时，应选择标有“微波炉适用”字样的容器。避免使用金属容器或带有金属装饰的餐具，以免引起火花。塑料容器需耐高温，普通塑料袋或保鲜膜高温下可能释放有害成分。加热液体时应防止过热导致爆沸，可中途搅拌使其受热均匀。
日常饮食建议多样化，避免长期单一食用加热食品。注意食物保存条件，避免反复加热导致细菌滋生。若加热后食物出现异味或异常性状，应停止食用。合理使用微波炉并注意操作规范，通常不会对健康造成负面影响。