人乳头瘤病毒16感染的治疗方法主要包括药物治疗、物理治疗、手术治疗等。人乳头瘤病毒16属于高危型人乳头瘤病毒，持续感染可能增加宫颈病变风险，需根据病情选择适宜方案。
1.药物治疗若感染人乳头瘤病毒16但未合并宫颈病变，可遵医嘱使用干扰素栓、保妇康栓或重组人干扰素α2b凝胶等药物。这类药物通过调节局部免疫反应或抑制病毒复制，帮助清除病毒。但需注意药物仅作为辅助治疗手段，无法确保完全转阴。
2.物理治疗对于存在宫颈低级别病变者，可采用激光、冷冻或微波等物理治疗。通过破坏受感染的宫颈上皮细胞，促进健康组织再生，约70%-80%患者经治疗后病毒载量可下降。治疗后需保持外阴清洁，2个月内避免性生活和盆浴。
3.手术治疗若病理检查确诊为宫颈高级别病变，需行宫颈锥切术或利普刀手术切除病变组织。术后需将切除组织送病理检查，明确边缘是否切净，术后3-6个月需复查人乳头瘤病毒和TCT。
建议确诊人乳头瘤病毒16感染后前往妇科门诊进行阴道镜检查和宫颈活检，明确是否存在宫颈病变。治疗期间应避免无保护性行为，性伴侣也需进行相关检查。所有治疗方案需在医生指导下进行，切勿自行使用宣称可“转阴”的保健品，以免延误病情或加重经济负担。