眼用凝胶通常需要滴入结膜囊内，即下眼睑与眼球之间的空隙。具体使用方法应在医生指导下进行，不可自行盲目操作，以免损伤眼部组织。
使用眼用凝胶时，需先洗净双手并擦干。用食指轻拉下眼睑暴露结膜囊，将凝胶尖端对准该位置挤入适量药物。注意避免让药瓶口接触睫毛或眼球表面，防止污染。操作后需闭眼休息1-2分钟，并用干净棉签轻压内眼角，减少药物经鼻泪管流失。
凝胶类眼用制剂相较于普通滴眼液具有更长的滞留时间，使用后可能出现短暂视物模糊，属于正常现象。若出现持续刺痛、红肿加重或视力下降等异常反应，应立即停用并就医。需特别注意的是，同时使用多种眼药时，建议先滴眼药水再使用凝胶制剂，间隔至少5分钟以确保药物吸收效果。