普通肠镜检查通常会引起一定的不适感，但多数患者可以忍受。检查过程中可能出现腹胀、牵拉感或短暂疼痛，具体感受因人而异，与个体耐受力、肠道形态及医生操作技巧有关。
检查时医生会将带有摄像头的软管从肛门插入，逐步推进至回盲部。肠道弯曲处可能因镜身摩擦产生疼痛，但操作者会通过注气、调整体位等方式减轻不适。对疼痛敏感或肠道结构异常的人群可能反应更明显，但剧烈疼痛较为少见。
检查前按医嘱做好肠道准备能减少不适，过度紧张可能放大疼痛感知。无法耐受者可选择无痛肠镜，检查后适当走动有助于排气缓解腹胀。若检查后出现持续腹痛或便血需及时就医。