核磁共振和CT在成像原理、适用部位、检查时间、辐射暴露以及禁忌症等方面存在区别，需根据病情选择。核磁共振利用磁场和射频脉冲生成图像，适用于软组织病变检查；CT则采用X射线断层扫描，对骨骼、肺部等组织显像效果较好。
1、成像原理不同
核磁共振通过磁场使体内氢原子共振并释放信号，经计算机处理生成图像，对软组织分辨率高。CT利用X射线穿透人体不同组织后的衰减差异成像，更适用于密度差异大的结构如骨骼。
2、适用部位差异
核磁共振在脑部、脊髓、关节、肌肉等软组织病变中具有优势，如脑肿瘤、韧带损伤等。CT常用于检查肺部结节、骨折、出血及腹部脏器急性病变，例如肺炎、颅脑外伤等。
3、检查时间长短
常规CT检查仅需数秒至数分钟即可完成，适合急诊患者。核磁共振单部位检查通常需要15-30分钟，对于儿童或幽闭恐惧症患者可能需要镇静辅助。
4、辐射暴露区别
CT检查涉及电离辐射，多次重复检查可能累积辐射剂量。核磁共振无电离辐射，适合儿童、孕妇等需避免辐射的群体，但妊娠早期仍需谨慎选择。
5、禁忌症不同
体内装有心脏起搏器、金属植入物或血管夹的患者禁止接受核磁共振成像，避免金属移位或产热。CT检查主要禁忌为对碘造影剂过敏者，但无金属植入限制。
进行影像学检查前应详细告知医生病史、过敏史及体内植入物情况。两种检查各有侧重，临床中常需结合血液检验、超声等结果综合判断，具体选择需遵循专业医师建议，避免因信息不全导致误诊或检查风险。