益生菌的服用时间通常建议在饭后或随餐服用，具体时间可根据个人情况和医生指导进行调整。不同剂型的益生菌可能对服用时间有不同要求，例如片剂或胶囊建议随餐服用，散剂或滴剂可空腹服用。
随餐或饭后服用可减少胃酸对益生菌活性的影响，此时胃酸分泌较少且食物中和了部分胃酸，有利于益生菌顺利到达肠道定植。早晨或晚上服用均可，但需保持时间规律以维持肠道菌群稳定。若服用抗生素类药物，需间隔2小时以上再服用益生菌，避免抗生素杀灭有益菌。
服用益生菌期间应避免饮酒或进食辛辣刺激食物，以免影响菌群活性。需注意益生菌不能替代药物治疗，若存在腹痛、腹泻等症状加重或持续不缓解，应及时就医。具体服用方案应遵医嘱，根据个体肠道状况调整剂型和剂量。