南瓜通常没有严格不能一起吃的食物，但某些情况下需注意搭配方式。日常饮食中适量食用南瓜并合理搭配其他食材，通常不会引起明显不适。若食用后出现胃肠不适，建议及时调整饮食结构。
南瓜含有丰富的淀粉和膳食纤维，与红薯、土豆等高淀粉食物同时大量食用可能增加消化负担。淀粉在消化过程中会产生气体，过量摄入可能导致腹胀或消化不良。胃肠功能较弱的人群需注意控制摄入量，避免加重不适。
南瓜从中医角度属于温性食物，与羊肉、韭菜等温热性食材搭配时需适量。此类组合可能使体内燥热加重，易出现口干舌燥、便秘等症状。体质偏热或处于上火状态的人群更需注意食用量，必要时可搭配清热食材如冬瓜、芹菜等平衡膳食。
南瓜作为日常蔬菜，建议采用蒸煮等清淡烹调方式。特殊人群如糖尿病患者需注意，尽管南瓜升糖指数中等，但过量食用仍可能影响血糖稳定。若在食用南瓜后出现皮肤发黄等胡萝卜素血症表现，通常减少摄入后可自行恢复，必要时可咨询营养科医师调整膳食方案。